Ngay sau khi trở về từ U23 Việt Nam, Nguyễn Lê Phát đã tỏa sáng ở vòng loại U21 Quốc gia 2025.
Sau quãng thời gian tập huấn ở Bà Rịa Vũng Tàu, HLV Kim Sang Sik đã loại tổng cộng 13 cầu thủ để chốt danh sách chính thức 23 cầu thủ tham dự giải U23 Đông Nam Á 2025. Ở trong lần rút gọn danh sách đầu tiên của U23 Việt Nam, Lê Phát của PVF là 1 trong số 8 cái tên phải nói lời chia tay.
Thực tế đây không phải điều quá bất ngờ khi Lê Phát mới chỉ sinh năm 2007, tiền đạo trẻ này khó lòng cạnh tranh với các người đàn anh giàu kinh nghiệm trên hàng công như Quốc Việt, Đình Bắc hay Thanh Nhàn. Việc được triệu tập lên U23 Việt Nam là động thái giúp Lê Phát tích lũy thêm kinh nghiệm và học hỏi từ những người đồng đội.

Trở về từ U23 Việt Nam, Nguyễn Lê Phát quay trở lại đội hình thi đấu của U21 PVF tại vòng loại U21 Quốc gia 2025. Tài năng được mệnh danh là Mbappe Việt Nam cũng đã ngay lập tức để lại dấu ấn với 1 bàn thắng vào lưới TTBĐ Đào Hà trong chiến thắng 7-0 của U21 PVF.
Thực tế Lê Phát không phải là cầu thủ đầu tiên tỏa sáng ở vòng loại U21 Quốc gia khi bị loại khỏi U23 Việt Nam. Những cái tên khác như Đăng Dương (Viettel), Đinh Quang Kiệt (HAGL) cũng đã nổ sung ngay sau khi trở về CLB. Điều này cho thấy dù bị loại ở U23 Việt Nam nhưng đây vẫn là những cầu thủ xuất sắc nhất của đơn vị chủ quản.

Biệt danh Mbappe Việt Nam của Lê Phát bắt nguồn từ vòng loại U17 châu Á 2023. Lê Phát là một trong số những cái tên cực kỳ đáng chú ý trong màu áo U17 Việt Nam. Tiền đạo này khi đó mới 15 tuổi đã tỏa sáng với 2 pha lập công ngay trong trận đấu quốc tế đầu tiên của mình gặp U17 Đài Bắc Trung Hoa và trở thành trụ cột của U17 Việt Nam.
Chứng kiến màn trình diễn của Lê Phát, cựu cầu thủ Trịnh Quốc Hưng so sánh sao mai PVF với siêu sao Kylian Mbappe của bóng đá Pháp: "Cậu ấy không thể khiến tôi ngừng liên tưởng đến Kylian Mbappe. Lê Phát thực tế đã sớm phát huy khả năng ở giải U13 Quốc gia, trong màu áo U13 PVF".